【目次】
序
＜基礎編＞
基本知識
1 実験動物を用いた撮影に必要な法令・指針の基礎知識 〜動物行動動画解析を行う前に知っておくべきこと
2 人工知能の基礎知識 〜人工知能，機械学習，ニューラルネットワーク
3 公開されている動物行動解析用ソフトウェアを知る
4 既存動物行動解析手法の系譜とその限界，そしてAIへの期待
主要ソフトウェアの使い方
5 DeepLabCutの使い方
6 はじめてのMATLABコーディング：YOLOを動かす
7 OpenCVを使った画像処理
＜実践編＞
齧歯類の行動解析
1 DeepLabCutを用いたラットの歩行分析
2 DeepLabCutとSimple Behavioral Analysisを用いたマウスの社会性評価
3 ラットの発声と行動のオープンソース環境による統合解析
霊長類の行動解析
4 FulMAIを用いたマーモセットの行動解析
5 マーモセットの頭部固定下での行動と神経活動の同時計測システム構築
6 AIによるサル複数個体の姿勢推定
魚類や虫の行動解析
7 YOLOを使った水槽内の魚類の検出—トラフグを例に
8 AI技術を活用した昆虫の行動解析・介入ツール
9 姿勢推定アルゴリズムによる線虫の行動解析
＜番外編＞
1 マウスホームケージモニタリング 〜長期・自動的なデータ取得とその運用
＜発展編＞
プログラミングによる高精度な行動解析
1 動画解析を用いた実験動物の自発運動の評価法
2 深層学習を利用したマウスのひっかき行動，グルーミング行動の解析
3 深層学習を用いた複数匹のマウスを追跡する技術
4 深層学習モデルを用いた高精度なマウスの行動分類
5 機械学習と情報理論によるゼブラフィッシュの行動解析
6 ゼブラフィッシュ実験のAI品質管理システム
汎用化された解析システム・委託解析
7 マウスのAI行動解析システムSHIGUSAを用いた解析
8 共同研究・外注解析のコツ 〜創薬のDXに向けた正しい解析のために
索引
