はしがき
1 心の差別の章（入真言門住心品）
2 マンダラを建立する真言蔵章（入漫荼羅具縁真言品）
3 障礙を息滅すべき広大章（息障品）
4 普通真言蔵広大章（普通真言蔵品）
5 世間人の悉地成就章（世間成就品）
6 悉地成就の真実広大章（悉地出現品、成就悉地品）
7 本尊の三摩地を決定する章（説本尊三昧品）
8 無相三摩地章（説無相三昧品）
9 世間と出世間の念誦の真実章（世出世持誦品）
10 字輪広大章（転字輪漫荼羅行品）
11 印の広大章（密印品）
12 一切処に入る門戸たる法の文字道の章（字輪品）
13 秘密マンダラ章 （秘密漫荼羅品）
14 秘密マンダラに入る章 （入秘密漫荼羅法品）
15 秘密八印章（秘密八印品）
16 秘密マンダラを受持することに入る広大章（入秘密漫荼羅位品）
17 明咒の律儀広大章（持明禁戒品）
18 阿闍梨の真実を知る章（阿闍梨真実智品）
19 字を布置する広大章（布字品）
20 方便と相応する菩薩の学処の章（受方便学処品）
21 百字出生を教示する章（説百字出生品）
22 〔百字〕果相応を教示する章（百字果相応品）
23 百字を布置し成就する章（百字位成品）
24 〔百字の〕自性を成就する章（百字成就持誦品）
25 百字真言儀軌章（百字真言法品）
26 正覚者の自性を教示する章（説菩提性品）
27 三三摩耶を行ずる章（三三摩耶品）
28 如来を説く章（説如来品）
29 真言門より菩薩行を行ずる儀軌章（世出世護摩法品、嘱累品）
