大規模データで困ったときに、まず図を描くことからはじめる生命科学データ解析

実験医学別冊

大規模データで困ったときに、まず図を描くことからはじめる生命科学データ解析

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オーディオブック

編：河野　暢明

出版社：羊土社

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内容紹介

シングルセル，メタゲノムseq，プロテオームなどの膨大なデータは『図』として可視化してこそ，真価が引き出されます．UMAP，MAプロット，ヒートマップ…本書では生成AIの力を借りながら自分で思いのままに可視化する方法を解説します！作図プロセスを通してデータの核心を掴み，より本質的な研究に進みたいあなたへ

【目次】
はじめに
本書の使い方
プログラミングの基本事項

第Ⅰ部　生命科学データ別にファーストアクションを学ぶ
第1章ゲノム
第2章トランスクリプトーム
第3章メタゲノム/16S rRNA アンプリコンシークエンスデータ
第4章 ChIP（クロマチン免疫沈降）-seq
第5章 Hi-Cデータ
第6章シングルセルトランスクリプトーム　〜公開データとの統合・比較解析
第7章プロテオーム　〜網羅的なタンパク質解析と図表作成・データ登録
第8章顕微鏡データ　〜デジタルステイニングによる細胞核の可視化と形態解析
第9章高速原子間力顕微鏡（AFM）データ

第Ⅱ部　LLMとの対話を通じて理想のデータビジュアルをつくる
第1章データから適切なグラフを選ぶ方法
第2章環状ゲノムマップ　〜Circosを用いた作成方法
第3章ヒートマップ
第4章主成分分析（PCA）
第5章注釈付き系統樹
第6章 ChIP（クロマチン免疫沈降）-seqピーク解析
第7章 UMAP・Trajectory解析　〜シングルセルRNA-seqデータの描画
第8章 MAプロット・Volcanoプロット　〜RStudioを使用した遺伝子発現変動を示す図の描き方

索引
執筆者一覧

付属物

スクリプト

ISBN：9784758122825
出版社：羊土社
判型：B5
ページ数：349ページ
定価：5400円（本体）
発行年月日：2025年07月
発売日：2025年07月04日
国際分類コード【Thema（シーマ）】１：PSAX
国際分類コード【Thema（シーマ）】２：PSAK
国際分類コード【Thema（シーマ）】３：PSAB
国際分類コード【Thema（シーマ）】４：MBNS。

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