出版社を探す

バイオインフォマティクス

Pythonによる実践レシピ

著:Antao,T.
訳:阿久津 達也
訳:竹本 和広

紙版

内容紹介

Pythonを中心とするツール群の活用例を具体的なレシピ約50で紹介。目の前の研究に活かせる。環境構築から丁寧に解説。〔内容〕次世代シークエンス/ゲノム解析/集団遺伝学/系統学/タンパク質/データ公開・共有/ビッグデータ/他

〇本書で学べること
・次世代シーケンス(NGS)データ解析の進め方
・FASTQ, BAM, VCFフォーマットのデータの取扱い
・Galaxyへのアクセス
・Dask, Sparkなどを活用した大規模データ処理
・Cytoscapeによる可視化
・主成分分析,決定木分析など機械学習の活用

目次

1. Pythonとソフトウェア環境
2. 次世代シーケンス・データ解析
3. ゲノム解析
4. 集団遺伝学
5. 集団遺伝学のシミュレーション解析
6. 系統解析
7. 蛋白質構造データバンク(PDB)を使う
8. バイオインフォマティクスにおけるパイプライン
9. Pythonによるゲノムビッグデータ解析
10. バイオインフォマティクスのその他のトピック
11. 高度な次世代シーケンス解析

著者略歴

著:Antao,T.
Pythonの主要なバイオインフォマティクス・パッケージであるBiopythonの開発者のひとり

ISBN:9784254122541
出版社:朝倉書店
判型:A5
ページ数:320ページ
定価:5200円(本体)
発行年月日:2020年08月
発売日:2020年08月03日
国際分類コード【Thema(シーマ)】 1:PSAK