目次

序にかえて－個体を分解して理解するシングルセルゲノミクス

第1章　総論：プロジェクト・技術の動向
1．シングルセルゲノミクスのプラットフォーム
2．医学・生物学研究に実装されるシングルセルゲノミクス
3．シングルセルRNA-seq情報解析最前線
4．世界と日本におけるHuman Cell Atlasの構築

第2章　シングルセル解析によるバイオロジー
Ⅰ．発生・臓器・オルガノイド
1．心筋シングルセル解析による病態解明から臨床応用
2．腸管上皮のシングルセル解析
3．肝臓オルガノイドのシングルセル解析
4．単細胞レベルでの膵内分泌細胞の不均一性と機能解明
5．シングルセル解析で広がるヒト腎臓発生と病態の理解
6．シングルセルRNA-seqを用いた肺線維症の解析―データベースを用いた具体的な解析方法の紹介

Ⅱ．免疫・がん
7．シングルセルレベルでのT細胞受容体・B細胞受容体解析
8．T細胞におけるシングルセル解析
9．レンバチニブと抗PD-1抗体の併用による腫瘍免疫調節作用の解析
10．大腸がん組織を構成する細胞集団の多様性
11．シングルセル遺伝子発現解析からみえてきた腫瘍内不均一性
12．成人T細胞白血病研究におけるシングルセル解析の有用性
13．HTLV-1感染動態の数理モデル型定量的データ解析
14．リキッドバイオプシーの実現に向けた血中循環腫瘍細胞のシングルセル解析

Ⅲ．その他
15．iPS細胞のシングルセル遺伝子発現解析
16．1細胞RNA-Seqによる神経前駆細胞の制御機構解析の動向
17．ウイルス感染細胞の不均一性（heterogeneity）の網羅的描出
18．メタゲノムデータからの微生物ゲノムの再構成

第3章　技術開発
1．進歩を続ける1細胞トランスクリプトーム計測法
2．シングルセルゲノム情報解析の基盤技術
3．クロマチン挿入標識法（ChIL）による単一細胞エピゲノム解析
4．シングルセル遺伝子発現解析（Nx1-seq）と細胞集団
5．C1 CAGE法を用いた一細胞転写開始点解析
6．マイクロバイオームのシングルセル解析
7．蛍光イメージングによる網羅的シングルセル解析
8．SINC-seq法による1細胞多階層解析