総 論 吉森 保
1 オートファジーとは何か
2 オートファジー関連因子と基本メカニズム
1．オートファジーを駆動・制御するタンパク質
2．オートファゴソーム膜の起源
3 オートファジーが関連する疾患
第Ⅰ部 オートファジー研究のこれまでの歩み
第1章 オートファジー研究の歴史（ATG以前） 上野 隆
1-1 リソソームの発見からオートファジーの概念の確立まで
1-2 プレATG時代のオートファジー研究の成果
1．オートファジーの飢餓誘導と非選択性
2．グルカゴンとインスリンによるオートファジーの調節
3．アミノ酸によるオートファジーの調節
4．培養細胞によるオートファジー研究
5．オートファゴソーム膜の起源を巡って
第2章 酵母が切り開いたオートファジー研究の曙 野田 健司
2-1 酵母のオートファジー研究の源流
2-2 酵母におけるオートファジーの発見
2-3 apg変異株の単離
2-4 APG遺伝子の同定
2-5 ATGへの統合
2-6 Atg間の関係性の氷解
第Ⅱ部 オートファジーの分子機構
第3章 オートファジーの誘導と抑制をつかさどる2つのキナーゼAtg1/Ulk1とTORC1 荒木 保弘・野田 健司
3-1 富栄養下でオートファジーが抑制される仕組み
1．哺乳類TORC1のアミノ酸感知機構
2．出芽酵母のTORC1活性化経路
3．Rag-Ragulatorに依存しないTORC1活性化経路
4．TORC1の基質
3-2 飢餓でオートファジーが誘導される仕組み
1．ATG遺伝子の発現誘導
2．Atg1/Ulk1キナーゼの活性化
3．Atg1/Ulk1キナーゼの基質
第4章 オートファゴソームの形成における膜動態のメカニズム 中戸川 仁
4-1 Atgタンパク質の分子機能
4-2 Atgタンパク質のオートファゴソーム形成部位への集積
4-3 オートファゴソームの膜の源：小胞体のオートファゴソーム形成への関与
第5章 哺乳類細胞におけるオートファゴソーム成熟の分子機構 小山-本田 郁子・水島 昇
5-1 幕開け：オートファゴソーム成熟の分子機構解明へ
5-2 オートファゴソームの閉鎖
5-3 オートファゴソームの輸送
5-4 リソソームとの融合
5-5 リソソーム酵素による分解
Column オートファゴソーム内膜の分解をとらえた！ 5-6 オートファゴソームの成熟機構に残された課題
第6章 オートファゴソームの内膜分解と分解産物の再利用に機能する分子装置 関藤 孝之
6-1 オートファゴソーム内膜小胞の分解
6-2 液胞/リソソームからの分解産物の排出・再利用
1．リソソームにおけるアミノ酸トランスポーターの発見
2．AAAPトランスポータ
3．Atg22
4．PQループタンパク質
5 オートファジー分解産物の再利用に関する研究の展望
Column 液胞を巡る研究
第7章ATG分子群の構造と機能 野田 展生
7-1 Atg1/ULK複合体
7-2 オートファジー特異的PI3K複合体
7-3 Atg結合系
第8章 ミクロオートファジー 奥 公秀・阪井 康能
8-1 ミクロオートファジー研究の流れ
8-2 ミクロオートファジーの分子機構
8-3 ミクロオートファジー研究の課題と展望
第9章 出芽酵母の選択的オートファジー 鈴木 邦律
9-1 選択的オートファジーの足場タンパク質：Atg11
9-2 Atg11依存的選択的オートファジー
9-3 Atg11非依存的な選択的オートファジー
第10章 哺乳類選択的オートファジー概論 一村 義信・小松 雅明
10-1 選択的オートファジー発見の歴史
10-2 選択的オートファジーとは
10-3 ユビキチンシグナルとコアATGタンパク質
10-4 レセプタータンパク質
10-5 選択的オートファジー各論
10-6 選択的オートファジーと連動したシグナル伝達
第11章 ミトコンドリア分別・除去システムの基本原理 岡本 浩二
11-1 歴史的背景と意義
11-2 マイトファジーをどうとらえるか
11-3 分別標識タンパク質：レセプター
11-4 分別標識タンパク質：ユビキチン
11-5 多細胞生物の初期発生とミトコンドリア分解
11-6 今後の展望：未解決の根本問題と新たな可能性
Column 酵母が導く現象から分子理解への冒険
第12章 ゼノファジー：病原体の排除システム 阿部 章夫
12-1 病原細菌とゼノファジー
12-2 ゼノファジーによる病原細菌の選択的排除
12-3 病原細菌におけるゼノファジーの対抗戦略
Column 細菌学者から見たゼノファジー
第Ⅲ部 オートファジーの生理機能
第13章 マウスでのATG の意義 吉井 紗織・水島 昇
13-1 マウスにおけるオートファジーの生理的意義
1．胚発生
2．全身でオートファジー関連因子を欠損するマウスの表現型
3．組織特異的オートファジー不全マウスの表現型
13-2 マウスにおけるATGのオートファジー以外のはたらき
1．感染・炎症制御
2．網膜色素上皮細胞でのレチノイドのリサイクル
3．破骨細胞の波状縁形成と骨吸収
第14章 植物のさまざまな局面におけるオートファジーの生理機能 吉本 光希
14-1 非生物的ストレス適応
1．栄養素のリサイクル
2．高塩・乾燥・高温・低酸素ストレス適応
14-2 植物免疫
14-3 オルガネラ品質管理
1．クロロファジー
2．ペキソファジー
3．レティキュロファジー
4．マイトファジー
第15章 オートファジーと核酸代謝 川俣 朋子
15-1 非選択的オートファジーによるRNA分解と選択的なリボソーム分解（リボファジー） 15-2 細胞内凝集体，RNA顆粒の分解（グラニュロファジー，アグリファジー） 15-3 核および核小体の分解（ヌクレオファジー，PMN） 15-4 病原体の分解（ゼノファジー），ウイルス分解とミトコンドリア分解
15-5 RNautophagy/DNautophagy
15-6 RNaseとDNase
15-7 RNA/DNAの分解後の運命：細胞内輸送と細胞内の核酸代謝系との接点
第16章 栄養飢餓とオートファジー 久万 亜紀子
16-1 飢餓応答
16-2 オートファジーと栄養供給
1．タンパク質分解
2．脂質分解
3．グリコーゲン分解
16-3 栄養によるオートファジーの制御
1．ホルモン
2．アミノ酸
3．栄養応答性転写因子
Column 新生仔マウスのオートファジー
第Ⅳ部 オートファジーと疾患・臨床応用
第17章 パーキンソン病の分子病態とオートファジー-リソソーム系の破綻 佐藤 栄人・服部 信孝
17-1 孤発性パーキンソン病とミトコンドリア研究
17-2 遺伝性パーキンソン病の原因遺伝子とタンパク質分解異常
17-3 遺伝性パーキンソン病とミトコンドリア品質管理の破綻
17-4 パーキンソン病とLewy小体
17-5 オートファジー-リソソーム系と封入体形成
17-6 遺伝性パーキンソン病とリソソームの破綻
第18章 オートファジーと癌 川端 剛・吉森 保
18-1 癌抑制遺伝子としてのオートファジー遺伝子
18-2 癌の進行とオートファジー
18-3 抗癌剤としてのオートファジー阻害剤
18-4 オートファジー阻害剤の応用と問題点
第19章 オートファジーと代謝性疾患 藤谷 与士夫・福中 彩子
19-1 膵β細胞におけるオートファジー
19-2 脂肪細胞とオートファジー
19-3 脂肪細胞のベージュ化とオートファジー
19-4 肝細胞とオートファジー
第20章 オートファジーと老化 中村 修平・吉森 保
20-1 寿命制御経路で共通して必要なオートファジーの活性化
20-2 インスリン/IGF-1シグナル
20-3 TORシグナル
20-4 カロリー制限
20-5 生殖腺からのシグナル：生殖細胞除去
20-6 ミトコンドリア機能抑制
20-7 オートファジーの誘導による抗老化と寿命延長
20-8 寿命制御におけるオートファジー制御因子
20-9 オートファジー活性化による抗老化と寿命延長のメカニズム
第21章 オートファジーと心疾患 種池 学・大津 欣也
21-1 非ストレス下の心臓におけるオートファジー
21-2 ストレス下の心臓におけるオートファジー
21-3 炎症とオートファジー
21-4 老化とオートファジー
21-5 マイトファジー
Column 筆者らの研究とオートファジー
第22章 オートファジーと腎疾患 高橋 篤史・猪阪 善隆
22-1 定常状態でのオートファジー
Column1 腎臓におけるオートファジーの歴史は古い！
22-2 腎疾患におけるオートファジー
Column2 リソソームの主要制御因子TFEB
22-3 腎臓におけるオートファジー研究の展望
22-4 腎臓におけるシャペロン介在性オートファジー（CMA）
日本語索引
外国語索引
