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アルゴリズム・サイエンスシリーズ　【適用事例編】 12

バイオインフォマティクスの数理とアルゴリズム

著：阿久津　達也

紙版

出版社サイト。

内容紹介

タンパク質立体構造や生体内ネットワークを詳述

第1章　分子生物学概観
1.1　DNAとRNA
1.2　セントラルドグマ
1.3　タンパク質
1.4　分子生物学とデータベース

第2章　配列アラインメント
2.1　ペアワイズアラインメント
2.2　ローカルアラインメント
2.3　線形領域アラインメント
2.4　スコア行列とアラインメントスコアの統計的評価
2.5　ホモロジー検索
2.6　マルチプルアラインメント

第3章　配列解析
3.1　配列モチーフ
3.2　隠れマルコフモデル
3.3　カーネル法
3.4　ゲノム配列推定
3.5　ゲノム再編成

第4章　進化系統樹推定
4.1　有根系統樹と無根系統樹
4.2　系統樹の個数
4.3　距離行列法
4.4　最節約法
4.5　進化の確率モデル
4.6　系統樹の評価と比較

第5章　高次構造解析
5.1　RNA2次構造予測
5.2　RNA2次構造比較
5.3　タンパク質立体構造予測
5.4　タンパク質立体構造比較

第6章　ネットワーク解析
6.1　遺伝子発現データ解析
6.2　遺伝子ネットワーク
6.3　タンパク質相互作用推定
6.4　ネットワーク構造解析

参考文献
索引