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あなたにも役立つバイオインフォマティクス

編：菅原　秀明

紙版

出版社サイト。

内容紹介

　ゲノムサイエンス、タンパク質科学の急速な進展に伴い、遺伝子、タンパク質の膨大なデータが蓄積されつつある。本書はこれらをどうやって使いこなすか、バイオサイエンス領域の一般のユーザーを対象としてやさしくわかりやすく解説する入門書である。インターネットに接続されたパソコンとブラウザさえあれば使えるデータベースと解析ツールについて、その利用方法と注意点を具体的に紹介するもので、実践的な解説をするために、検索や解析結果の実例画面を多数盛り込んでいる。データベースを使って必要なデータを集めるところから始めて、決定した配列からさまざまな“生物学的意味”を引き出し、最終的には公共データベースに登録するところまでを導く。

0．使えるバイオインフォマティクス

1．配列を手に入れる―DDBJが提供するSRSシステムによる検索の仕方

2．既知の配列と比較する：相同性検索

3．配列に共通のパターンを探す――CLUSTALWを中心としてマルチプルアラインメントの方
法を紹介

4．配列から遺伝子の進化を探る

5．アミノ酸配列から既知のパターンを探す：モチーフ検索

6．立体構造を手に入れる―PDBの利用方法

7．アミノ酸配列の保存領域からタンパク質を知る

8．立体構造の類似性を知る

9．アミノ酸配列から2次構造を予測する

10．アミノ酸配列から立体構造を予測する

11．ゲノム配列から遺伝子を発見する

12．遺伝子ネットワークを使いこなす

13. 生理活性脂質データベースを利用する

14. 公共データベースに登録する
DDBJへの登録/PDBへの登録

15. Q&A
・配列からの遺伝子系統樹解析を役立てるには？　
・アルゴリズムって何？隠れマルコフモデルって何？

掲載URL一覧
索引