目次

Ⅰ　概説――地球・人間・微生物

1　微生物学の歴史 
　1.1　ヒトと微生物の出会い　
　1.2　微生物学の発展に寄与した人々　
2　地球と微生物　
　2.1　微生物の進化史　
　2.2　地球と微生物の共進化　
　2.3　地球の資源と微生物　
3　微生物の分類と系統
　3.1　微生物の分類と命名　
　3.2　ウイルスの系統分類　
　3.3　細菌の系統分類　
　3.4　古細菌の系統分類　
　3.5　真菌の系統分類　
　3.6　原生動物の系統分類　
　3.7　真核微細藻類の系統分類　
4　微生物の分離・培養・保存 
　4.1　分　離　
　4.2　培　養　
　4.3　保　存　
5　分子生物学におけるモデル生物としての微生物 
　5.1　モデル微生物としての大腸菌
　5.2　出芽酵母　
　5.3　クロレラとクラミドモナス　

Ⅱ　発酵と微生物

1　食品生産に関わる微生物 
　1.1　発酵食品に関わる微生物　
　1.2　酒類に関わる微生物　
　1.3　健康食品　
2　機能物質生産微生物
　2.1　医薬品　
　2.2　農薬・家畜薬　
　2.3　酵素生産　
　2.4　化粧品　
　2.5　食品関連分野　
3　バイオコンバージョン（生物変換）に関わる微生物
　3.1　はじめに（ステロイド誘導体）
　3.2　理論，方法論　
　3.3　応　用　
　3.4　代謝工学　

Ⅲ　農業と微生物

1　作物と微生物 
　1.1　土の中の微生物とその働き　
　1.2　根粒菌　
　1.3　Frankiaによる共生窒素固定
　1.4　菌根菌と植物の共生関係
　1.5　エンドファイト　
　1.6　葉面微生物　
　1.7　拮抗微生物を利用した病害防除
2　植物の病害と微生物
　2.1　植物の病害　
　2.2　植物病原微生物
　2.3　主要な植物の病害　
　2.4　植物病害の診断　
　2.5　植物と病原微生物の相互作用　
　2.6　植物の保護　
　2.7　植物病原微生物の利用　
3　家畜病原微生物 
　3.1　家畜の病原微生物と伝染病　
　3.2　家畜の病原ウイルス
　3.3　家畜のプリオン　
　3.4　家畜の病原細菌　
　3.5　家畜の原虫　
　3.6　家畜の常在性病原体　
　3.7　家畜伝染病の防除　
4　畜産と微生物 
　4.1　ルーメン微生物　
　4.2　飼料の微生物汚染　
　4.3　畜産物の微生物汚染　
　4.4　サイレージ微生物　
5　昆虫と微生物 
　5.1　昆虫の微生物研究の歴史
　5.2　昆虫の糸状菌病　
　5.3　昆虫の細菌病　
　5.4　昆虫のウイルス病　
　5.5　昆虫の原生動物による病気　
　5.6　昆虫寄生性線虫　
　5.7　昆虫が媒介する動物・植物の病気　
　5.8　昆虫共生微生物の種類とその特徴　
　5.9　共生微生物の宿主への影響　
　5.10　昆虫関連微生物の利用
6　水産と微生物  
　6.1　餌料微生物（餌料プランクトン）
　6.2　貝毒プランクトン　
　6.3　病原微生物　
7　農業環境と微生物 
　7.1　農地から派生する窒素，リン酸による環境汚染と微生物　
　7.2　農地から発生する温室効果ガス（メタン，亜酸化窒素）と微生物
　7.3　共生微生物を利用した荒廃土壌の回復
　7.4　農畜産廃棄物，生ごみのリサイクルと微生物
　7.5　土壌微生物による農薬の分解

Ⅳ　健康と微生物

1　健康を左右する腸内細菌叢の構成とプロバイオティクス
2　健康・病気に関与している常在菌の構造と機能
　2.1　免　疫　
　2.2　アレルギー
　2.3　コレステロール代謝
　2.4　が　ん　
　2.5　潰瘍性大腸炎　
　2.6　腸管感染症　
　2.7　歯周病疾患　
3　体内常在菌のコントロール
　3.1　発がん物質の排泄　
　3.2　インフルエンザ感染予防
　3.3　接着機構と腸内細菌のコントロール

Ⅴ　食品（貯蔵・保存）と微生物

1　食品微生物
　1.1　食品の細菌
　1.2　食品の真菌（カビ・酵母）
2　食品の腐敗 
　2.1　腐敗とは　
　2.2　腐敗微生物　
　2.3　腐敗による食品の変化　 
　2.4　腐敗の判定　
3　食中毒
　3.1　食中毒の歴史　
　3.2　腐敗と食中毒　
　3.3　食中毒微生物　
　3.4　食中毒微生物の検出と計数
4　予測微生物学　
5　食品の保存法
　5.1　食品保存の歴史　
　5.2　低温貯蔵　
　5.3　乾燥・塩蔵　
　5.4　有機酸による食品の保存　
　5.5　加熱による食品の保存　
　5.6　食品保存料　
　5.7　その他の保存法　
6　ハードルテクノロジー 
7　食品の衛生管理
　7.1　GMP（適正製造規範）
　7.2　HACCPシステム　
　7.3　食品法規　

Ⅵ　病気と微生物

1　世界的規模の感染症 
　1.1　ウイルス感染症　
　1.2　細菌感染症　
　1.3　原虫症　
　1.4　性感染症（STD）　
　1.5　輸入真菌症　
2　日和見感染症と新興・再興感染症
　2.1　日和見感染症　
　2.2　新興・再興感染症　
3　幼稚園・学校保健で問題となる感染症
　3.1　伝染性ウイルス感染症　
　3.2　虫　歯
4　微生物の危険性と取扱い
　4.1　バイオセーフティの確保―病原微生物の危険度分類と安全取扱い
　4.2　感染症の予防および感染症の患者に対する医療に関する法律（感染症法）

Ⅶ　環境と微生物

1　物質循環に関わる微生物
　1.1　C循環
　1.2　N循環　
　1.3　S循環　
2　水質汚染に関わる微生物
　2.1　陸水環境を汚染する微生物　
　2.2　海洋環境を汚染する微生物　
　2.3　飲料水を汚染する微生物
3　生物多様性の減少と微生物
　3.1　スイゼンジノリ（絶滅危惧Ⅰ類種）
　3.2　ビンタマカビ　
　3.3　タンポポ浮腫病菌　
　3.4　シイノキ類葉ぶくれ病菌　
　3.5　シンジュタケ　
4　環境汚染（汚濁）の指標と診断に関わる生物 
　4.1　環境指標生物　
　4.2　生物検定用微生物　
5　バイオエネルギーに関わる微生物 
　5.1　メタンの酸化　
　5.2　水素生成　
　5.3　石油生成　
6　環境浄化・修復に関わる微生物 
　6.1　環境浄化・保全微生物　
　6.2　バイオレメディエーション（環境修復微生物）

Ⅷ　生活・文化と微生物

1　生活環境と微生物
　1.1　室内空気　
　1.2　ダスト　
　1.3　衣　類　
　1.4　寝　具　
　1.5　生活用家電製品　
　1.6　住　宅　
　1.7　結露と微生物　
　1.8　抗菌製品・抗菌剤
　1.9　微生物汚染と制御　
　1.10　公共施設と微生物　
2　ペットと微生物 
　2.1　ペットのウイルス病と予防
　2.2　ペットの細菌病と予防　
　2.3　ペットの原虫病と予防　
3　文化遺産と微生物
　3.1　文化財保存科学と微生物　
　3.2　文化財の微生物被害の実態　
　3.3　微生物被害の対策　
4　微生物による材料の劣化と防御 
　4.1　微生物による建築木材の腐朽
　4.2　レンズに発生するカビ　
　4.3　微生物によるコンクリートの劣化

Ⅸ　新しい微生物の利用と課題

1　新たな微生物機能の活用 
　1.1　難培養微生物　
　1.2　ミニマムゲノムセルファクトリー
　1.3　メタゲノム　
　1.4　DNAシャフリング　
　1.5　バイオフィルム
　1.6　バイオプロセス　
2　極限環境と微生物資源 
　2.1　好熱菌　
　2.2　低温微生物　
　2.3　好圧性微生物　
　2.4　好アルカリ性菌　
　2.5　好酸性菌　
　2.6　好塩菌　
　2.7　放射線抵抗性細菌　
　2.8　深部地下環境　
3　微生物利用に関わる安全性や知財権への取組み
　3.1　バイオテロリズム　
　3.2　生態系―バイオセーフティに関するカルタヘナ議定書について　
　3.3　植物検疫および動物検疫
　3.4　知財権―ブダペスト条約を中心に
　3.5　生物多様性条約―遺伝資源へのアクセスと利益配分の国際ルール

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